Агроперлит широко используется в сельском хозяйстве и огородничестве для улучшения почвенной структуры, удержания влаги и повышения воздухопроницаемости. Он может быть добавлен в грунт или использоваться в качестве отдельного слоя для выращивания растений. Агроперлит также используется в гидропонике и других системах без почвы для поддержки корневой системы растений. Кроме того, агроперлит может использоваться в качестве материала для фильтрации воды и очистки сточных вод.